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本门大部分是水生光合真核生物,仅少数无细胞壁、原生质体裸露,多数绿藻有细胞壁。光合作用色素是叶绿素a和b,以及β胡萝卜素和几种叶黄素;贮藏能量主要是淀粉;运动细胞常具2根顶生、等长的鞭毛鞭毛,少数种类具4条,亦有极少量具1条或6条、8条的现象。形态多样,藻体有单细胞、群体、丝状体、叶状体、管状多核体等各种类型。有性生殖很普遍,分别为同配、异配或卵配;其在某些情况下也可以进行营养繁殖和无性生殖。
在淡水和海水中均有分布,海产种类约占10%,淡水产种类约占90%。
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